Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STRIP1Q5VSL9 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms