Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 AVIL-201ENST00000257861 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 METTL13-201ENST00000361735 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 PTGER4P2-CDK2AP2P2-201ENST00000619442 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 ITGB6-204ENST00000409967 2292 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 ZSCAN30-211ENST00000610712 3439 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 RNPC3-202ENST00000524631 2013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 LDLRAD3-201ENST00000315571 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 CCDC36-204ENST00000452691 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 AC005921.3-201ENST00000623774 2151 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 SLC5A11-208ENST00000565769 2214 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 GRPEL2-201ENST00000329271 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C5orf47Q569G3 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms