Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms