Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms