Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC017083.4-201ENST00000406334 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms