Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PROX2Q3B8N5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms