Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms