Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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