Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms