Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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NCOA1Q15788 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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NCOA1Q15788 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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NCOA1Q15788 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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NCOA1Q15788 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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NCOA1Q15788 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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NCOA1Q15788 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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NCOA1Q15788 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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NCOA1Q15788 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA1Q15788 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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