Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TWIST1Q15672 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms