Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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