Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEA1Q15075 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms