Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB39AQ14964 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms