Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GBX1Q14549 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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