Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IKBKEQ14164 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms