Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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