Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PEX6Q13608 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PEX6Q13608 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PEX6Q13608 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX6Q13608 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PEX6Q13608 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PEX6Q13608 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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PEX6Q13608 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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PEX6Q13608 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PEX6Q13608 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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