Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CAMK2DQ13557 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms