Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PMS2P3Q13401 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PMS2P3Q13401 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PMS2P3Q13401 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PMS2P3Q13401 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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