Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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GPS1Q13098 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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GPS1Q13098 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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GPS1Q13098 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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GPS1Q13098 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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GPS1Q13098 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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GPS1Q13098 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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