Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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FOXD4Q12950 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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FOXD4Q12950 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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FOXD4Q12950 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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