Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNH2Q12809 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNH2Q12809 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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