Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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FOXO1Q12778 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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FOXO1Q12778 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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FOXO1Q12778 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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FOXO1Q12778 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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