Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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