Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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FAM27E3Q08E93 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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