Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA3Q08378 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA3Q08378 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms