Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME1Q06323 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms