Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms