Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN12Q05209 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms