Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC6Q03468 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms