Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMF1P82094 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMF1P82094 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms