Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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