Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms