Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PGGT1BP53609 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PGGT1BP53609 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PGGT1BP53609 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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