Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPFP49454 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPFP49454 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPFP49454 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms