Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCLMP48507 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms