Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms