Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms