Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDF5P43026 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDF5P43026 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDF5P43026 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms