Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC19A1P41440 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms