Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL1P40616 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL1P40616 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARL1P40616 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARL1P40616 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARL1P40616 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARL1P40616 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARL1P40616 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARL1P40616 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARL1P40616 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARL1P40616 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARL1P40616 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARL1P40616 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 254.5 ms