Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFNP31947 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFNP31947 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFNP31947 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms