Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms