Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms