Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PSMB5P28074 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PSMB5P28074 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PSMB5P28074 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PSMB5P28074 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PSMB5P28074 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSMB5P28074 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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