Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFP26441 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFP26441 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFP26441 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFP26441 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFP26441 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFP26441 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFP26441 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFP26441 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFP26441 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFP26441 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFP26441 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFP26441 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFP26441 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFP26441 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFP26441 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFP26441 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFP26441 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFP26441 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFP26441 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTFP26441 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTFP26441 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTFP26441 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTFP26441 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTFP26441 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTFP26441 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTFP26441 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTFP26441 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTFP26441 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTFP26441 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms