Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
YY1P25490 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YY1P25490 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YY1P25490 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YY1P25490 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YY1P25490 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
YY1P25490 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YY1P25490 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YY1P25490 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
YY1P25490 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YY1P25490 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YY1P25490 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YY1P25490 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YY1P25490 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YY1P25490 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
YY1P25490 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YY1P25490 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YY1P25490 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YY1P25490 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
YY1P25490 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YY1P25490 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
YY1P25490 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
YY1P25490 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YY1P25490 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YY1P25490 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
YY1P25490 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
YY1P25490 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YY1P25490 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
YY1P25490 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
YY1P25490 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms