Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms