Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DMDP11532 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DMDP11532 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DMDP11532 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DMDP11532 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DMDP11532 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
DMDP11532 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
DMDP11532 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DMDP11532 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
DMDP11532 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DMDP11532 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DMDP11532 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DMDP11532 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DMDP11532 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DMDP11532 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DMDP11532 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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